Si potrebbe pensare che una volta scelto un ottimo software in grado di riconoscere e copiare CD o DVD con protezioni, il gioco è fatto: basterà inserire un CD o DVD vergine e la copia 1:1 verrà confezionata senza problemi. E invece no. La maggiorparte, anzi la quasi totalità, dei masterizzatori in commercio, non sono in grado di copiare le protezioni di ultima generazione. Nei CD-ROM Audio e nei DVD-ROM commerciali, oltre a dati e audio visibili, vi sono settori aggiuntivi riservati alle codifiche di correzione degli errori (ECC) usate per inserire dati volutamente corrotti. Diverse protezioni tra i settori 800 e 10.800 dei CD-ROM inseriscono settori "deboli" (weak sector) non leggibili dai masterizzatori non dotati di una corretta codifica EFM (Eighty to Fourty Modulation). Altre zone del disco sono destinate a contenere dati speciali che descrivono la struttura fisica del supporto.Parliamo delle RMPS (Recordable Media Physical Signature): in queste zone sono inseriti apposta dei dati aggiuntivi che i masterizzatori in fase di copia non riescono a trasferire sul CD/DVD vergine. Quando si avvia il software, esso effettua un controllo sulle aree EFM, RMPS oppure MDS del CD copiato, si accorge di non trovare i dati cercati e blocca l'esecuzione del programma. La quasi totalità dei masterizzatori non è in grado di trasferire correttamente sulla copia dati codificati in questo modo. Possiamo dunque dire che procurarsi un software specifico come Alcohol o CloneCD è condizione necessaria, ma non sufficiente, a garantire la perfetta riuscita della copia. Il resto dipende dall'hardware del masterizzatore, in particolare le SafeDisk 3.x, le SecuRom 4.x sono incopiabili senza un masterizzatore apposito. A tale scopo, rinomato per la copia di CD con protezione risulta essere il masterizzatore Plextor Premium. Esso supporta una perfetta codifica EFM, è in grado di leggere dati dai weak sector (settori deboli) e di trasferire il contenuto 1:1 senza errori. Tra i masterizzatori DVD, sono noti per la loro efficienza i masterizzatori DVD+/-R Plextor 4824a, 708a, 712a e 716a, anch’essi dotati di meccaniche di alta precisione e funzioni speciali per la lettura di supporti con protezione. Questi masterizzatori hanno un costo superiore del 30%-50% rispetto a prodotti analoghi, ma sono spesso l'unica soluzione per il backup di CD e DVD con protezioni.